【次世代基因定序學程】

NGS實驗、數據判別、資料處理、運算分析實作及統計工具應用

 

次世代定序(Next Generation Sequencing, NGS)又稱為高通量平行定序(Massively Parallel Sequencing, MPS),透過同時間大量的短序列片段定序展現高速和高通量效能,降低單一鹼基定序所須之成本。近年來已有NGS儀器與搭配試劑/伴同式診斷試劑通過美國FDA體外診斷醫療器材(In vitro Diagnostics, IVDs)核准,應用於臨床檢測診斷,加速精準醫療的進展。

NGS設備、實驗技術發展已趨成熟,然在實驗數據品質判別、資料處理、運算分析、統計、大數據資料庫驗證等階段的方法、工具、流程建立與標準化仍有許多待突破之處,為提升藥物/療法研發成功率、檢測診斷準確率、治療策略精準度、疾病預後成效,精進上述各階段技能以強化試驗結果的正確關聯性推論,儼然成為關鍵成功要素。

本學程屬循序漸進的系統性培訓,搭配每人一台桌機的形式,即時同步學習數據品質判別、資料處理、運算分析,將深化您對職涯的規劃,誠摯邀請您帶著手邊現有的NGS數據資料(DNA Sequences Paired-end Reads FASTQ File,來與我們一同造訪這基因解密後的創新研發、精準醫療&精準健康新視

 

日期

主題

4/15(四)

NGS原理及實驗儀器介紹-全臺重量級生物多樣性研究中心

4/16(五)

NGS實驗數據品質判別、運算分析環境置備與實機演練-數據資料優劣破解秘技

4/17(六)

NGS統計方法、工具及大數據進階分析應用實例探討-創新研發&精準健康向前行

 

課程資訊

  • 時間:2021415日(四)13:30417日(六)17:00,連續兩天半,共15.5小時
  • 學習目標:
  • 熟悉NGS數據資料產生過程、處理方法、分析流程及統計、生物資訊工具,且能自行運算操作
  • 能對生醫大數據提出合理的要求,並了解在各階段可能產生的誤差
  • 對象:生技製藥產業、生醫研發團隊、受託基因定序機構等之從業人員或主管,醫療機構從事癌症醫學、基因分子診斷、產前遺傳檢測等之醫事人員,非生物資訊相關領域的研究人員,及有意投入相關領域或感興趣者
  • 費用:原價NT$12,800;兩人同行,每人NT$11,500;三人同行,每人NT$10,200
  • 3/31(三)前完成繳費報名,享早鳥優惠NT$10,990;兩人同行,每人NT$9,990;三人同行,每人NT$8,990
  • 請各學員均填寫線上報名表,同時註明同行學員姓名及公司名稱/任職機構
  • 課後授予課程時數證明

 

課程內容

  • 時間:2021.4.15Thur13:3017:0513:10開始報到)
  • 地點:國家生技研究園區C1C123演講廳(臺北市南港區研究院路一段13099號)
  • 主題:NGS原理及實驗儀器介紹-全臺重量級生物多樣性研究中心

Time

Topic

Speaker

13:3013:35

Opening

黃千岳 博士

DCB生技產業學院 特聘專家

財團法人生物技術開發中心

13:3513:55

生醫大數據分析-從NGS談起

黃培瑛 博士

數位健康規劃小組 計畫主持人

財團法人生物技術開發中心

Theme 1NGS實驗

13:5515:25

NGS原理

呂美曄 博士/研究副技師

生物多樣性研究中心 實驗室主持人

中央研究院

15:2515:35

Break

15:3517:05

NGS實驗儀器介紹

呂美曄 博士/研究副技師

生物多樣性研究中心 實驗室主持人

中央研究院

 

  • 時間:2021.4.16Fri09:3017:0009:10開始報到)
  • 地點:聯成電腦館前分校(臺北市館前路25樓)
  • 主題:NGS實驗數據品質判別、運算分析環境置備與實機演練-數據資料優劣破解秘技
  • 講師:劉傳崑 總經理,道品股份有限公司

Time

Topic

Theme 2NGS數據資料分析實作

09:3010:30

認識NGS資料

10:3010:40

Break

10:4011:40

NGS資料運算分析原理介紹

11:4012:40

Lunch

12:4013:40

NGS資料近端在地分析軟硬體環境置備解說

13:4013:50

Break

13:5014:50

使用POSH在地智慧基因體分析平台運算分析NGS數據資料

14:5015:00

Break

15:0017:00

安裝與使用Integrative Genomics Viewer瀏覽NGS分析結果

 

  • 時間:2021.4.17Sat09:3017:0009:10開始報到)
  • 地點:國家生技研究園區C1C123演講廳(臺北市南港區研究院路一段13099號)
  • 主題:NGS統計方法、工具及大數據進階分析應用實例探討-創新研發&精準健康向前行

Time

Topic

Speaker

Theme 3NGS統計方法、工具及大數據應用

09:3010:30

以基因表現量挑選疾病生物標記的統計方法

Statistical Approaches for Biomarker Identification by Differentially Expressed Genes

邵遵文 博士

數位健康規劃小組 研究員

財團法人生物技術開發中心

10:3010:40

Break

10:4011:40

基因訊息傳遞路徑分析之網路工具介紹

張哲維 博士

數位健康規劃小組 研究員

財團法人生物技術開發中心

11:4011:50

Break

11:5012:50

生物網路拓撲學與功能叢集分析

Network Analysis of Topological and Functional Clustering

林文賢 先生

數位健康規劃小組 副研究員

財團法人生物技術開發中心

12:5013:50

Lunch

13:5015:20

NGS生醫大數據進階分析應用實例探討(A

楊振翔 博士

統計科學研究所 副研究員

中央研究院

15:2015:30

Break

15:3017:00

NGS生醫大數據進階分析應用實例探討(B

楊振翔 博士

統計科學研究所 副研究員

中央研究院

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