【次世代基因定序學程】
NGS實驗、數據判別、資料處理、運算分析實作及統計工具應用
次世代定序(Next Generation Sequencing, NGS)又稱為高通量平行定序(Massively Parallel Sequencing, MPS),透過同時間大量的短序列片段定序展現高速和高通量效能,降低單一鹼基定序所須之成本。近年來已有NGS儀器與搭配試劑/伴同式診斷試劑通過美國FDA體外診斷醫療器材(In vitro Diagnostics, IVDs)核准,應用於臨床檢測診斷,加速精準醫療的進展。
雖NGS設備、實驗技術發展已趨成熟,然在實驗數據品質判別、資料處理、運算分析、統計、大數據資料庫驗證等階段的方法、工具、流程建立與標準化仍有許多待突破之處,為提升藥物/療法研發成功率、檢測診斷準確率、治療策略精準度、疾病預後成效,精進上述各階段技能以強化試驗結果的正確關聯性推論,儼然成為關鍵成功要素。
本學程屬循序漸進的系統性培訓,搭配每人一台桌機的形式,即時同步學習數據品質判別、資料處理、運算分析,將深化您對職涯的規劃,誠摯邀請您帶著手邊現有的NGS數據資料(DNA Sequences Paired-end Reads FASTQ File),來與我們一同造訪這基因解密後的創新研發、精準醫療&精準健康新視界!
日期 |
主題 |
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4/15(四) |
NGS原理及實驗儀器介紹-全臺重量級生物多樣性研究中心 |
4/16(五) |
NGS實驗數據品質判別、運算分析環境置備與實機演練-數據資料優劣破解秘技 |
4/17(六) |
NGS統計方法、工具及大數據進階分析應用實例探討-創新研發&精準健康向前行 |
課程資訊
- 時間:2021年4月15日(四)13:30~4月17日(六)17:00,連續兩天半,共15.5小時
- 學習目標:
- 熟悉NGS數據資料產生過程、處理方法、分析流程及統計、生物資訊工具,且能自行運算操作
- 能對生醫大數據提出合理的要求,並了解在各階段可能產生的誤差
- 對象:生技製藥產業、生醫研發團隊、受託基因定序機構等之從業人員或主管,醫療機構從事癌症醫學、基因分子診斷、產前遺傳檢測等之醫事人員,非生物資訊相關領域的研究人員,及有意投入相關領域或感興趣者
- 費用:原價NT$12,800;兩人同行,每人NT$11,500;三人同行,每人NT$10,200
- 3/31(三)前完成繳費報名,享早鳥優惠NT$10,990;兩人同行,每人NT$9,990;三人同行,每人NT$8,990
- 請各學員均填寫線上報名表,同時註明同行學員姓名及公司名稱/任職機構
- 課後授予課程時數證明
- 線上報名:線上報名連結
- 報名截止:2021年4月9日(五)
- 聯繫:周昀霈 教務經理 (02) 7700-3800 Ext. 5282;yunpei@dcb.org.tw
課程內容
- 時間:2021.4.15(Thur)13:30~17:05(13:10開始報到)
- 地點:國家生技研究園區C棟1樓C123演講廳(臺北市南港區研究院路一段130巷99號)
- 主題:NGS原理及實驗儀器介紹-全臺重量級生物多樣性研究中心
Time |
Topic |
Speaker |
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13:30-13:35 |
Opening |
黃千岳 博士 DCB生技產業學院 特聘專家 財團法人生物技術開發中心 |
13:35-13:55 |
生醫大數據分析-從NGS談起 |
黃培瑛 博士 數位健康規劃小組 計畫主持人 財團法人生物技術開發中心 |
Theme 1:NGS實驗 |
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13:55-15:25 |
NGS原理 |
呂美曄 博士/研究副技師 生物多樣性研究中心 實驗室主持人 中央研究院 |
15:25-15:35 |
Break |
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15:35-17:05 |
NGS實驗儀器介紹 |
呂美曄 博士/研究副技師 生物多樣性研究中心 實驗室主持人 中央研究院 |
- 時間:2021.4.16(Fri)09:30~17:00(09:10開始報到)
- 地點:聯成電腦館前分校(臺北市館前路2號5樓)
- 主題:NGS實驗數據品質判別、運算分析環境置備與實機演練-數據資料優劣破解秘技
- 講師:劉傳崑 總經理,道品股份有限公司
Time |
Topic |
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Theme 2:NGS數據資料分析實作 |
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09:30-10:30 |
認識NGS資料 |
10:30-10:40 |
Break |
10:40-11:40 |
NGS資料運算分析原理介紹 |
11:40-12:40 |
Lunch |
12:40-13:40 |
NGS資料近端在地分析軟硬體環境置備解說 |
13:40-13:50 |
Break |
13:50-14:50 |
使用POSH在地智慧基因體分析平台運算分析NGS數據資料 |
14:50-15:00 |
Break |
15:00-17:00 |
安裝與使用Integrative Genomics Viewer瀏覽NGS分析結果 |
- 時間:2021.4.17(Sat)09:30~17:00(09:10開始報到)
- 地點:國家生技研究園區C棟1樓C123演講廳(臺北市南港區研究院路一段130巷99號)
- 主題:NGS統計方法、工具及大數據進階分析應用實例探討-創新研發&精準健康向前行
Time |
Topic |
Speaker |
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Theme 3:NGS統計方法、工具及大數據應用 |
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09:30-10:30 |
以基因表現量挑選疾病生物標記的統計方法 (Statistical Approaches for Biomarker Identification by Differentially Expressed Genes) |
邵遵文 博士 數位健康規劃小組 研究員 財團法人生物技術開發中心 |
10:30-10:40 |
Break |
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10:40-11:40 |
基因訊息傳遞路徑分析之網路工具介紹 |
張哲維 博士 數位健康規劃小組 研究員 財團法人生物技術開發中心 |
11:40-11:50 |
Break |
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11:50-12:50 |
生物網路拓撲學與功能叢集分析 (Network Analysis of Topological and Functional Clustering) |
林文賢 先生 數位健康規劃小組 副研究員 財團法人生物技術開發中心 |
12:50-13:50 |
Lunch |
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13:50-15:20 |
NGS生醫大數據進階分析應用實例探討(A) |
楊振翔 博士 統計科學研究所 副研究員 中央研究院 |
15:20-15:30 |
Break |
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15:30-17:00 |
NGS生醫大數據進階分析應用實例探討(B) |
楊振翔 博士 統計科學研究所 副研究員 中央研究院 |
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